VI период – од 1. јануарa 2004. године
На основу Наредбе министра одбране од 29. септембра 2003. године формирана је Војнобезбедносна агенција (ВБА), као организацијска целина Министарства одбране.
Војнобезбедносна агенција је, 26. децембра 2003. године, представљена јавности, а званично је почела да функционише од 1. јануара 2004. године.
Коначно, доношењем Закона о Војнобезбедносној агенцији и Војнообавештајној агенцији, 2009. године, ВБА је успостављена као савремена и професионална служба безбедности, део безбедносно-обавештајног система Министарства одбране и Републике Србије.
Рад Војнобезбедносне агенције уређен је Законом о основама уређења служби безбедности Републике Србије, Законом о Војнобезбедносној агенцији и Војнообавештајној агенцији и подзаконским актима за његово спровођење. Законом о основама уређења служби безбедности Републике Србије уређене су основе безбедносно-обавештајног система Србије, усмеравање и усклађивање рада служби безбедности Републике Србије и надзор над њиховим радом. Законом о Војнобезбедносној агенцији и Војнообавештајној агенцији уређени су надлежности, послови, задаци, надзор и контрола ВБА и ВОА, сарадња као и друга питања значајна за њихов рад.
Војнобезбедносна агенција је, у оквиру својих надлежности, овлашћена да прикупља податке из јавних извора, од физичких и правних лица, од државних органа, организација и служби, ималаца јавних овлашћења, као и применом посебних поступака и мера тајног прикупљања података. У Закону су на транспарентан начин наведени посебни поступци и мере тајног прикупљања података и начин њиховог одобравања.
Законом је уређено да надзор над радом ВБА врши генерални инспектор, као орган министра одбране. Осим тога, контролу законитости рада и примене овлашћења припадника ВБА врши Унутрашња контрола, као орган директора ВБА. Извештаје о раду и о евентуалним злоупотребама и неправилностима у раду ВБА, Унутрашња контрола доставља директору ВБА. Ако директор ВБА не отклони уочену незаконитост или неправилност, руководилац Унутрашње контроле је дужан да о томе обавести генералног инспектора, а по потреби и надлежни одбор Народне скупштине.
Припадник ВБА који дође до сазнања да је у раду ВБА дошло до повреде уставности и законитости, људских права и слобода, професионалности, сразмерности у примени овлашћења и политичке и идеолошке неутралности, може непосредно да се обрати генералном инспектору, министру одбране, Влади и надлежном одбору Народне скупштине, без последица по свој статус. Осим тога, припадник ВБА може да се обрати генералном инспектору и надлежном одбору Народне скупштине и када сматра да су угрожена његова права у обављању послова и задатака из надлежности ВБА.
